好的益生菌必須具備3個標準：
1、益生菌是活的，具有很強的活性。
2、活的益生菌的數量（成年人需要補充10億株/天，嬰兒需要補充5億株/天）
3、該益生菌是否有保健作用（目前經過美國食品藥品監督管理局FDA認定的就10種益生菌有保健作用，其中長雙歧桿菌和嗜酸乳桿菌的組合配方就是FDA通過的配方目錄。FDA是目前世界上要求最嚴、標準最高的藥檢局）。
好的益生菌產品必須能耐高溫、耐酸等環境。益生菌多爲厭氧菌，不耐酸、高溫（不能高於40度）和鹼性環境，對外界環境極爲敏感，在加工、運輸、存儲過程中穩定性差易失活，喪失功能。另外，益生菌若要對人體產生有益作用，必須先通過胃環境才能達到腸道，但在胃酸和膽汁的作用下，大部分益生菌會死亡，最終使得體內沒有足夠的益生菌發揮作用，達不到保健和治療的目的，所以很多益生菌產品要求在飯前服用（飯前胃酸相對較少，飯後胃酸會增多）。爲確保益生菌能抵抗胃酸而順利到達腸道定殖，世界各頂級研究機構進行了大量的研究後認爲，將益生菌進行微膠囊包埋是目前最有效的一種方法。
好的益生菌產品還必須達到國際益生菌產品協會（IPA）的質量標準：
1、在產品失效時確保有最低數量的菌落形成單位（CFU）；
2、有儲存指示；
3、有包裝批號或產品代碼；
4、對益生菌清楚地識別，其中包括菌株（優先列出）或者至少以外界普遍認可的術語列明屬種，如果用商品名稱來識別益生菌，那麼實際的屬種也應該包含在產品標籤上；
5、生產廠家的所有聯繫信息，或者在產品標籤空間有限的情況下，至少列明廠家的網址；
6、建議用量的說明（供動物使用的益生菌補充劑應該列明其所針對的動物種類）。
另外，在選擇益生菌是還要注意是否有國家食品藥品監督管理局批准的保健食品批准文號和標誌；產品名是否已在國家商標局註冊（已註冊有○R或TM標誌）。
一些公司可能會聲稱其產品含有500億個單位的益生菌，但其中到底有多少是活着和有效的呢？有些益生菌產品聲稱在生產時含有一定數量的CFU，但是，這與消費者使用該產品時的CFU數量並不一定具有關聯性，因爲有一些產品利用了非活性培養方法（比如加入低聚果糖又名雙歧因子，它是益生菌的養料，它能讓人體腸道內的雙歧桿菌繁殖），但是缺乏臨牀支持，還有一些產品使用了死體培養。
一、什麼是益生菌
益生菌是一類對人有益的活性微生物，是定植於人體腸道、生殖系統內，能產生確切健康功效從而改善宿主微生態平衡、發揮有益作用的活性有益微生物的總稱。人體內有益的細菌或真菌主要有：酪酸梭菌、乳酸菌、雙歧桿菌、嗜酸乳桿菌、放線菌、酵母菌等。
可以通過給寶寶喝益生菌飲料來防治便祕密嗎？南京市兒童醫院營養醫師劉長偉表示，適量飲用有活性、菌株有效、數量充足的益生菌可以增加胃腸道內的益生菌的數量，或許能改善胃腸道功能。但不建議嬰幼兒、兒童通過常規靠飲用乳酸菌飲料來防治便祕。
一方面有的乳酸菌飲料裏的並不含活菌，有的只是一種口味，根本不含有活菌；就算是活菌，未必就是益生菌；就算是益生菌，未必達到足夠的量進入腸道發揮作用。
另一方面，從營養的角度來看，益生菌飲料中所含的蛋白質等營養成分較低，不能給寶寶提供足夠的營養。從健康的角度來看，大多數的益生菌飲料中都添加了較多的.糖分、甜味劑以及其他的食品添加劑，容易“綁架”孩子的味覺，降低孩子的食慾，導致寶寶偏食挑食，攝入營養素不足，嚴重的會造成營養素缺乏，引起營養不良、發育落後等問題；由於乳酸菌飲料中添加有較多糖份，大量飲用乳酸菌飲料，容易讓寶寶產生肥胖、齲齒等問題。
從預防效果上來看，目前並沒有證據表明益生菌飲料可以防治便祕，歐盟質檢機構也稱益生菌飲料無任何健康益處。因此，不建議嬰幼兒、兒童靠飲用乳酸菌菌飲料來防治便祕。
二、如何給寶寶補充益生菌
不建議寶寶常規飲用益生菌飲料，那麼該怎樣讓寶寶補充益生菌？劉長偉表示，寶寶補充益生菌，可通過兩種方式實現。
1、益生菌製劑
益生菌製劑是一種較爲安全的選擇，益生菌粉中起作用的是嗜酸乳桿菌、乳雙歧桿菌、鼠李糖乳桿菌、乾酪乳桿菌等益生菌，而且只有活着的菌羣纔有活性，才能起到調理腸道、提高免疫的功效。不同的活菌數量會影響功效。市面上從30萬、50萬、100萬、50億、300億活菌數含量的益生菌各不相同。人體攝入數量不是越高越好，家長一定要根據廠家安全指示正確服用。
需要注意的是，衝調含有益生菌的奶粉或益生菌製劑時，要使用溫開水(35-40℃)給寶寶服用，沖泡好的奶或益生菌製劑要及時服用，以免益生菌死亡失效。
2、益生菌酸奶
益生菌酸奶，是經益生菌發酵的酸牛奶，除了可以爲寶寶提供優質蛋白質和益生菌外，牛奶在發酵的過程中還會產生乳酸、多種B族維生素等，這些有益物質對寶寶的健康有重要作用。適量進食酸奶，既能夠獲得豐富的營養，也能獲得一定量的益生菌。
目前市面上有很多種由牛奶或奶粉、糖、乳酸或檸檬酸、蘋果酸、香料和防腐劑等加工配製而成的“乳酸奶”，其不具備酸牛奶的保健作用，家長在購買時要仔細識別。
如果寶寶經常便祕，應該多吃新鮮蔬菜和水果，增加飲食中的纖維攝入量，適量增加食用粗雜糧等，以擴充糞便體積，促進腸蠕動，減少便祕的發生，必要時，補充益生菌製劑，但菌量要足夠，否則效果不好。有些便祕是由於疾病導致的，對於通過飲食或補充益生菌不能糾正的寶寶，應及時到醫院就診，以免耽誤治療。
