會計電算化的發展雖然給企業帶來了巨大的效益，但給內部的控制和管理也帶來了新的問題和挑戰。
電算化會計管理的特點
（1）會計電子檔案具有技術性。
技術性文檔是解釋會計電子檔案的運行和設計情況，與會計電子檔案的設計和使用緊密相關。
（2）會計電子文檔缺乏直觀可視性。
會計電子檔案主要存儲於磁性介質上，與傳統的具有直觀可視性的會計檔案不一樣，會計電子檔案須在特定的計算機軟件和硬件環境中才能可視。
會計電子檔案對環境的依賴性強。會計電子檔案須依賴於計算機的軟件和硬件系統才能使用，而且它對儲存的周圍環境要求較苛刻。磁性介質不僅要求環境防火、防水、防塵、防磁，而且對溫度也有一定的要求。磁性介質對環境的高要求增加了數據的'脆弱性。
會計電子檔案對會計信息使用者的安全操作提出新要求。會計電子檔案的管理要求會計信息從事人員除了需具備會計專業知識，同時還得掌握必要的計算機操作和維護知識。
會計電子檔案管理缺乏有效的安全和保密措施。在網絡時代，新型磁性介質檔案管理是一種新型的管理方式，它取代了傳統的紙質管理。電子數據因其具有數據高度集中的特點，非常容易被泄密。電子數據是以數字編碼的程序的形式儲存在各種磁性介質上，但磁性介質具有體積小，存儲容量大的特點，正因爲此特點以致電子數據資料，泄密容易，而且範圍廣，涉及時間長，危害性也較大。
